สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาที่เล็งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะยารักษาโรคทางจิตเวช เช่น ภาวะซึมเศร้าและความวิตกกังวล หมู่ไพเพอร์ราซีนของมันมักถูกนำเข้าไปในโมเลกุลที่ออกแบบมาเพื่อโต้ตอบกับตัวรับสารสื่อประสาท เพิ่มประสิทธิภาพการรักษา นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารที่มีศักยภาพต้านมะเร็ง โดยโครงสร้างของมันช่วยยับยั้งเอนไซม์หรือเส้นทางเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเนื้องอก ความหลากหลายของสารนี้ในเคมียารักษาโรคทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่หลากหลาย