1-Boc-3-cyanopiperazine เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่างๆ รวมถึงยาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาทและมะเร็ง กลุ่ม Boc (tert-butyloxycarbonyl) ให้การป้องกันสำหรับหมู่ฟังก์ชันอะมีนในระหว่างปฏิกิริยาเคมีที่ซับซ้อน ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนแบบเลือกเฉพาะได้ กลุ่มไซยาโนให้ความยืดหยุ่นสำหรับการแปลงเคมีเพิ่มเติม ทำให้มีคุณค่าสูงในเคมียารักษา ความเสถียรและปฏิกิริยาของสารนี้ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบสำหรับการสร้างสารประกอบที่อิงจาก piperazine ซึ่งพบได้บ่อยในการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนายารักษา