1-Boc-4-(2-Aminophenyl)piperazine ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีและยา โดยเฉพาะในขั้นตอนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอะมิโนในระหว่างการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยาต้านอาการวิตกกังวล เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่ม piperazine และอะมิโนฟีนิลที่สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเฉพาะเจาะจงของยา นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาวิจัยทางเภสัชวิทยาเพื่อพัฒนายาใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาทและจิตเวชอีกด้วย