ไซลเดนาฟิล เอ็น-ออกไซด์เป็นเมแทบอไลต์หลักของไซลเดนาฟิล ถูกนำมาใช้ในการศึกษาวิจัยทางเภสัชวิทยาเพื่อทำความเข้าใจกลไกการออกฤทธิ์และกระบวนการเมแทบอลิซึมของไซลเดนาฟิล ซึ่งเป็นยารักษาภาวะหย่อนสมรรถภาพทางเพศและความดันโลหิตในปอดสูง โดยเฉพาะการตรวจสอบบทบาทของเอนไซม์ cytochrome P450 ในการเปลี่ยนไซลเดนาฟิลเป็นไซลเดนาฟิล เอ็น-ออกไซด์ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการใช้สารนี้ในการพัฒนาวิธีวิเคราะห์ทางเคมีและชีวภาพเพื่อวัดระดับยาและเมแทบอไลต์ในร่างกาย ซึ่งช่วยในการประเมินประสิทธิภาพเภสัชจลนศาสตร์ และความปลอดภัยของยา