1-Methyl-4-prop-2-ynyl-piperazine ถูกนำมาใช้ในวงการเภสัชวิทยาเพื่อการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยเฉพาะในกลุ่มสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง มันถูกศึกษาว่ามีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางจิตประสาทหรือยาที่ใช้ในการรักษาโรคทางจิตเวช นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอื่น ๆ ที่มีความซับซ้อนและเฉพาะทางในห้องปฏิบัติการวิจัย