1-Piperazin-1-ylacetone dihydrochloride ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาต่างๆ มีความสำคัญอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง โดยโครงสร้างของมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีศักยภาพเป็นยาต้านโรคจิต ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาคลายความกังวล นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาลิแกนด์สำหรับการศึกษา receptor เพื่อช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางชีวเคมีและปฏิกิริยาระหว่างยากับ receptor บทบาทของมันในเคมีเภสัชวิทยายืนยันถึงความสำคัญในการสร้างยารักษาโรคใหม่