1-[4-(Trifluoromethyl)เบนโซอิล]พิเพอร์ซีน ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมีเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีวงแหวนพิเพอร์ซีนและกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลเบนโซอิล ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าสำหรับการพัฒนายาที่มีผลทางรักษาที่เป็นไปได้ มักถูกนำมาใช้ในการออกแบบและผลิตสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้าและยาระงับประสาท เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับตัวรับสารสื่อประสาท นอกจากนี้ สารเคมีนี้ยังถูกสำรวจในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาแก้ปวด โดยใช้คุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรรของยา ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการประยุกต์ใช้ในการวิจัย ซึ่งถูกใช้ในการศึกษากลไกทางชีวเคมีและการโต้ตอบระหว่างยาและตัวรับ