สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาใหม่ๆ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งส่วนไพริมิดีนและไพเพอราซีน ซึ่งเป็นโครงสร้างหลักที่พบในสารออกฤทธิ์หลายชนิด เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ ยังสามารถใช้เป็นสารตั้งต้นในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือความจำเพาะของยา โดยเฉพาะในขั้นตอนการค้นหายาที่มีฤทธิ์เฉพาะเจาะจงต่อเป้าหมายทางชีวภาพ