ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ในฐานะตัวกลางที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ซึ่งวงแหวนเพอพิราซีนเป็นโครงสร้างหลัก กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ให้การป้องกันชั่วคราวของไนโตรเจน อนุญาตให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรที่ตำแหน่งอื่นในโมเลกุล แกนเพอพิราซีนที่ถูกแทนที่ด้วยเอทิลมีคุณค่ากในการสร้างยารองที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง โรคเมแทบอลิซึม และภาวะติดเชื้อ ใช้กันทั่วไปในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการเตรียมตัวยับยั้งไคเนสและตัวกระตุ้น/ตัวแอนตะโกนิสต์ของตัวรับ ได้รับความนิยมในสถานที่วิจัยเนื่องจากความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ และความง่ายในการถอดการป้องกันเมื่อจำเป็น