ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญที่ใช้งานได้ (APIs) ซึ่งต้องการวงแหวนเพอร์ไพพีราซีน การประยุกต์ใช้หลักอยู่ในกระบวนการเชื่อมต่อเปปไทด์และการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน ส่วนของเพอร์ไพพีราซีนที่ได้รับการป้องกันด้วย Cbz ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกสรรที่ตำแหน่งอื่นของโมเลกุล ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์แบบหลายขั้นตอน โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างตัวยับยั้งโปรติเอส ตัวแอนตากอนิสต์รีเซพเตอร์ และตัวยับยั้งไคเนส เนื่องจากมีกลุ่มคาร์บอนิลคลอไรด์ จึงทำปฏิกิริยากับเอมีนและแอลกอฮอล์ได้ง่ายเพื่อสร้างอะไมด์และเอสเตอร์ ทำให้สามารถดัดแปลงได้อย่างมีประสิทธิภาพ ความคงทนภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ และความง่ายในการกำจัดการป้องกันทำให้เป็นบล็อกสร้างที่ต้องการในกระบวนการค้นพบและพัฒนายา