ใช้เป็นตัวกลาง (intermediate) ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา (APIs) ที่ต้องการโครงสร้างพื้นฐานของพิเพอราซีน หมู่อะมีนที่ได้รับการป้องกันช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาแบบเลือกสรรได้ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ทำให้มีคุณค่าในการค้นคว้ายา ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวยับยั้งคินาส สารที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS-active compounds) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่ต้องการส่วนของพิเพอราซีนที่ถูกปรับแต่ง นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างโมเลกุลที่เลียนแบบเปปไทด์และเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมีแบบรวม (combinatorial chemistry) สำหรับห้องสมุดคัดกรองแบบความเร็วสูง