ใช้เป็นสารตัวกลางในการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ซึ่งวงแหวนพิเพอร์ราซีนทำหน้าที่เป็นโครงสร้างหลัก หมู่ tert-butyl carbamate (Boc) ให้การป้องกันสำหรับหมู่อะมีนในระหว่างปฏิกิริยาหลายขั้นตอน อนุญาตให้เกิดปฏิกิริยาเลือกเฉพาะที่อื่นๆ หลังจากการแปลงที่ต้องการ หมู่ Boc สามารถถูกถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อนเพื่อปลดปล่อยอะมีนอิสระ สารประกอบนี้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาในการสร้างยารักษาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง โรคเมแทบอลิซึม และมะเร็ง เนื่องจากคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีที่เกิดจากส่วน methylpiperazine