ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและยาตัวสมัคร โครงสร้างแกนพิเพอราซีนพร้อมกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลและกลุ่มเทอร์ต-บูทอกซีคาร์บอนิล (Boc) ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้นและความสัมพันธ์ในการจับที่ดีขึ้น ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งคินาส สารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง และสารต้านไวรัส กลุ่ม Boc ช่วยในการป้องกันอะมีนได้ง่ายระหว่างการสังเคราะห์หลายขั้นตอน ในขณะที่ส่วนไตรฟลูออโรเมทิลเพิ่มลิโพฟิลิกและชีวเภสัชจลนศาสตร์ ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบส่วนประกอบออกฤทธิ์ใหม่