ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม สำหรับพัฒนายาที่มีเป้าหมายไปยังระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า ยาคลายกังวล หรือยาต้านจิตประสาท เนื่องจากโครงสร้างของสารมีพิเพอร์ราซีน ซึ่งมักพบในโมเลกุลของยาที่ออกฤทธิ์ต่อตัวรับในสมอง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารอนุพันธ์ใหม่ผ่านการดัดแปลงกลุ่มฟังก์ชัน เช่น การลดหมู่ไนโตรเป็นหมู่อะมิโน หรือการตัดหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) เพื่อเปิดพิเพอร์ราซีนสำหรับทำปฏิกิริยาต่อไป