ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในขั้นตอนการสร้างสารตั้งต้นสำหรับยารักษาโรคต่าง ๆ เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาทางระบบประสาท หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อตัวรับในสมอง เนื่องจากโครงสร้างไซโคลพรอพิลพิเพอร์ราซีนมีความสำคัญต่อการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกัน (protecting group) ที่ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่ง ทำให้สามารถสร้างสารที่มีความบริสุทธิ์และเลือกจำเพาะทางสเตอริโอ (stereoselective) ได้สูง เหมาะสำหรับการใช้ในสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว (one-pot synthesis) หรือในระบบสังเคราะห์อัตโนมัติ