ใช้ในงานสังเคราะห์สารเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างพิเพอร์ราซีน ซึ่งมักพบในโมเลกุลของยาหลายชนิด เช่น ยาทางระบบประสาทส่วนกลาง ยาต้านจุลชีพ และยาแก้แพ้ โครงสร้างที่มีหมู่คาร์บอกซิเลตป้องกัน (Boc) และหมู่อัลไคน์ทำให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อเนื่องได้หลากหลาย เช่น ปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) ผ่านหมู่อัลไคน์ หรือการกำจัดหมู่ป้องกันเพื่อเปิดใช้ไนโตรเจนในพิเพอร์ราซีนสำหรับต่อเติมโครงสร้างอื่น จึงนิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่