N-Boc-piperazine-C3-COOH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการเตรียมสารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีวงแหวน piperazine ที่ได้รับการป้องกันด้วย Boc และกลุ่มกรดคาร์บอกซิล ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบและสังเคราะห์โมเลกุลยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายับยั้งโปรติเอส แอนตากอนิสต์ตัวรับ และตัวแทนทางชีวภาพที่ใช้งานอื่นๆ กลุ่ม Boc ให้การป้องกันสำหรับหน้าที่อะมีนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ อนุญาตให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรที่ตำแหน่งอื่นๆ ส่วนของกรดคาร์บอกซิลช่วยให้เกิดการดัดแปลงเพิ่มเติม เช่น การสร้างพันธะอะไมด์หรือเอสเทอร์ริฟิเคชัน ซึ่งอำนวยความสะดวกในการสร้างห้องสมุดเคมีที่หลากหลายสำหรับการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์เปปไทโดมิมิติกส์และสารประกอบอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด ความเข้ากันได้กับเทคนิคการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งยังทำให้มีประโยชน์ในการเคมีแบบคอมบิเนตอรีและการคัดกรองแบบไฮสปีด