(R)-1-Boc-3-Isopropylpiperazine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โครงสร้างแบบ chiral ของสารนี้ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตยาที่บริสุทธิ์แบบ enantiomer ซึ่งมักมีประสิทธิภาพสูงกว่าและมีผลข้างเคียงน้อยกว่า สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับงานวิจัยเคมียารักษาโรค ซึ่งช่วยในการสำรวจตัวแทนบำบัดใหม่ๆ กลุ่ม Boc ที่ป้องกันอะมีนช่วยให้สามารถถอดการป้องกันได้อย่างเลือกสรร สนับสนุนการปรับเปลี่ยนทางเคมีเพิ่มเติมในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน