โทรพิโนนใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ต่าง ๆ โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับตระกูลอัลคาลอยด์โทรพาแนน มีบทบาทสำคัญในการผลิตยาต้านโคลินเออร์จิก ซึ่งใช้รักษาโรคเช่น โรคพาร์กินสัน อาการเมารถ และบางชนิดของการวางยาพิษ เนื่องจากมีความคล้ายคลึงทางโครงสร้างกับอะโทรปีนและสโคโปลามีน โทรพิโนนจึงทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาอนุพันธ์ที่มีผลกระทบทางระบบประสาทแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ยังมีคุณค่าในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์และเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาเส้นทางการสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน กลไกเอนไซม์ เส้นทางชีวสังเคราะห์ของอัลคาลอยด์ การพัฒนาวิธีสังเคราะห์แบบสเตรโอเซเลคทีฟ และการประเมินฤทธิ์ทางชีวภาพเบื้องต้น แม้จะไม่ใช้โดยตรงเป็นยาในทางคลินิก