อินดิรูบินเป็นสารที่มีศักยภาพในการใช้รักษาโรคต่างๆ โดยเฉพาะโรคทางด้านเนื้องอกและมะเร็ง เนื่องจากมีคุณสมบัติในการยับยั้งการทำงานของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการแบ่งเซลล์ เช่น ไคเนส (kinase) ซึ่งช่วยควบคุมการเจริญเติบโตของเซลล์ที่ผิดปกติ โดยเฉพาะในเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ อินดิรูบินยังแสดงฤทธิ์ต้านการอักเสบ ทำให้มีศักยภาพในการใช้รักษาโรคเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบ เช่น โรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ และโรคผิวหนังบางชนิด เช่น สะเก็ดเงิน งานวิจัยบางชิ้นยังพบว่าสารนี้อาจมีผลต่อระบบประสาท โดยช่วยปกป้องเซลล์ประสาทจากความเสียหาย ซึ่งอาจนำไปสู่การพัฒนาเป็นยารักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์หรือโรคพาร์กินสันในอนาคต โดยรวม อินดิรูบินถือเป็นสารธรรมชาติที่น่าสนใจสำหรับการพัฒนายาใหม่ๆ โดยเฉพาะในด้านการรักษามะเร็งและการควบคุมการอักเสบ