ใช้ในทางการแพทย์เพื่อรักษาหูด โดยเฉพาะหูดข้าวสาร (molluscum contagiosum) และหูดธรรมดา โดยการทายาที่มีสารแคนทาริดินลงบนผิวหนัง ซึ่งจะช่วยให้เนื้อเยื่อของหูดตายและหลุดออก นิยมใช้ในเด็กและผู้ใหญ่ที่ไม่ต้องการใช้วิธีรักษาด้วยการเผาหรือผ่าตัด นอกจากนี้ยังมีการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับการใช้แคนทาริดินในการรักษามะเร็ง เนื่องจากมีฤทธิ์ยับยั้งการทำงานของโปรตีนฟอสฟาเทส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการแบ่งตัวของเซลล์ แต่ยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและไม่ได้ใช้ในทางคลินิกทั่วไป