ใช้บราซิลินเป็นสีย้อมธรรมชาติในอุตสาหกรรมสิ่งทอและอาหาร โดยให้สีแดงถึงสีม่วงขึ้นอยู่กับค่า pH มักใช้ร่วมกับมอร์แดนท์ เช่น ไอออนโลหะอย่างอลูมิเนียมหรือเหล็ก เพื่อช่วยยึดสีให้คงทนบนผ้า

ในด้านการแพทย์และวิทยาศาสตร์ นำมาใช้ในฮิสโทโลยีเป็นสารย้อมสีสำหรับการตรวจสอบเนื้อเยื่อใต้กล้องจุลทรรศน์ โดยเฉพาะเพื่อเน้นโครงสร้างเซลล์ เช่น นิวเคลียส

บราซิลินมีคุณสมบัติเป็นสารต้านอนุมูลอิสระในสูตรเครื่องสำอางและเภสัชภัณฑ์บางชนิด นอกจากนี้ ยังมีการวิจัยถึงคุณสมบัติต้านการอักเสบและต้านจุลินทรีย์ รวมถึงการนำมาใช้ในยาแผนโบราณเพื่อประโยชน์ทางสุขภาพ