อัลิซารินถูกใช้เป็นสีย้อมในอุตสาหกรรมสิ่งทอ โดยเฉพาะในการย้อมผ้าฝ้าย ผ้าลินิน และผ้าขนสัตว์ให้ได้สีแดงหรือม่วงแดงที่คงทน อีกทั้งยังใช้ในอุตสาหกรรมเครื่องสำอาง เช่น การผลิตสีสำหรับลิปสติกและบลัชออน เนื่องจากให้สีสันที่น่าดึงดูดและปลอดภัยต่อผิวหนัง ในงานวิจัยทางชีวเคมี อัลิซารินถูกใช้เป็นตัวชี้วัดในการศึกษาการตกตะกอนของแคลเซียม โดยเฉพาะในกระบวนการวิเคราะห์การสร้างกระดูกหรือหินปูนในเนื้อเยื่อ เนื่องจากสามารถจับกับแคลเซียมได้ดีและให้สีที่มองเห็นได้ชัดภายใต้กล้องจุลทรรศน์ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมสีและหมึกพิมพ์ เพื่อเพิ่มความเข้มของสีและปรับเฉดสีให้หลากหลายมากขึ้น