สารเคมีนี้ใช้หลักๆ เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือตัวทำปฏิกิริยาในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับการก่อตัวพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม โครงสร้างฟอสโฟนีอัมทำให้มีประสิทธิภาพในการอำนวยความสะดวกปฏิกิริยาการจับคู่ต่างๆ เช่น ปฏิกิริยา Wittig ซึ่งช่วยในการสร้างอัลคีนจากอัลดีไฮด์หรือคีโตน นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยาและเคมีภัณฑ์ละเอียด เนื่องจากความสามารถในการทำให้ตัวกลางปฏิกิริยาที่ทำปฏิกิริยาเสถียร ไอออนเตตราเฟลูออโรบอเรตช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียรในตัวทำละลายอินทรีย์ ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในสภาวะปฏิกิริยาที่หลากหลาย การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงกระบวนการโพลิเมอไรเซชันและวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาโพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบ