4-Nitrophenyl phenylphosphonate ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาฟอสโฟรีเลชัน โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมเอสเทอร์ฟอสโฟเนตต่างๆ ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนายา พีช เคมีเกษตร และสารประกอบชีวภาพที่ใช้งานได้ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การศึกษาการยับยั้งเอนไซม์ โดยเฉพาะในการตรวจสอบเอนไซม์ฟอสฟาทาสและเอสเทอเรส ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวยับยั้ง นอกจากนี้ ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการปรับเปลี่ยนพื้นผิวและโพลิเมอร์เพื่อเสริมคุณสมบัติ บทบาทของมันในกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรมยืนยันความสำคัญในการพัฒนาการประยุกต์ทางเคมีและชีวเคมี