ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรมเป็นสารกลางในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพ โดยเฉพาะในการผลิตสารประกอบอะโรมาติกที่ฟลูออรีนและโบรมีน โครงสร้างฮาโลเจนทำให้มีคุณค่าในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Heck reactions ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้บ่อยในการพัฒนายากลุ่มระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านการอักเสบ เนื่องจากความสามารถในการปรับกิจกรรมทางชีวภาพเมื่อรวมเข้าในยาที่ใหญ่กว่า นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ที่มีความเสถียรและความจำเพาะต่อเป้าหมายที่เพิ่มขึ้น