Alpha-fluorophenylacetic acid ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และตัวยารักษาอื่นๆ อะตอมฟลูออรีนในโครงสร้างช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษา นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยอนุพันธ์ของมันช่วยในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง สารนี้ยังถูกใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการยับยั้งเอนไซม์และการจับกับตัวรับ ช่วยในการค้นพบยาใหม่ๆ ความตอบสนองที่หลากหลายทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีศักยภาพในการใช้งานอุตสาหกรรมและชีวการแพทย์