เบนซิลไตรเมทิลแอมโมเนียม ฟลูออไรด์ ไฮเดรต ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาแบบถ่ายโอนเฟสในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ เพื่ออำนวยความสะดวกในการเกิดปฏิกิริยาระหว่างสารประกอบในเฟสที่แตกต่างกัน มีประสิทธิภาพสูงเป็นพิเศษในปฏิกิริยาฟลูออรีนแบบนิวคลีโอฟิลิก ซึ่งช่วยนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลอินทรีย์ สิ่งนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในกระบวนการผลิตยา สารเคมีเกษตร และสารเคมีพิเศษ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการเตรียมสารประกอบออร์กาโนฟลูออรีน ซึ่งถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในวิทยาศาสตร์วัสดุและเคมียารักษา รูปแบบไฮเดรตช่วยให้มีความเสถียรและง่ายต่อการจัดการในกระบวนการทดลองและอุตสาหกรรมต่างๆ