ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาแบบถ่ายโอนเฟส (phase-transfer catalyst) ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับอนุพันธ์กรดอะมิโนและหมู่ฟังก์ชันซัลโฟเนต โครงสร้างแบบซวิทเทอริออนิกช่วยเพิ่มความละลายในเฟสน้ำและเฟสอินทรีย์ ทำให้เกิดปฏิกิริยาได้ในสภาวะอ่อนโยน นิยมใช้ในกระบวนการจับคู่เปปไทด์ (peptide coupling) ลำดับการป้องกัน-ถอนป้องกัน (protection-deprotection) และการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพที่มีหมู่ซัลโฟเนต มีความเสถียรภายใต้สภาวะการจัดการหมู่ป้องกัน Boc ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์หลายขั้นตอนในการพัฒนายา