ไทรปซินถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในหลายด้าน โดยเฉพาะในทางชีววิทยาและเวชศาสตร์ ในห้องปฏิบัติการ ไทรปซินใช้ในการย่อยโปรตีนเพื่อแยกเซลล์ออกจากกัน โดยเฉพาะในการเพาะเลี้ยงเซลล์ ซึ่งช่วยให้เซลล์แยกตัวออกจากพื้นผิวและสามารถนำไปใช้ในการทดลองต่อได้ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการแยกและวิเคราะห์โปรตีนในงานวิจัยทางชีวเคมี ในทางการแพทย์ ไทรปซินถูกใช้เป็นส่วนประกอบในยาทาเพื่อช่วยรักษาบาดแผลและลดการอักเสบ โดยช่วยกำจัดเนื้อเยื่อที่ตายแล้วและกระตุ้นการหายของแผล นอกจากนี้ยังมีการใช้ในอุตสาหกรรมอาหารเพื่อปรับปรุงคุณภาพของผลิตภัณฑ์โปรตีน เช่น การย่อยโปรตีนในกระบวนการผลิตอาหารเสริมหรือผลิตภัณฑ์นม ไทรปซินจึงเป็นเอนไซม์ที่มีความสำคัญและมีประโยชน์หลากหลายในหลายสาขา