ไคโตซานถูกนำมาใช้ในหลายอุตสาหกรรมเนื่องจากคุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ ในอุตสาหกรรมอาหาร ใช้เป็นสารกันบูดและสารเพิ่มความหนืด ช่วยยืดอายุการเก็บรักษาของผลิตภัณฑ์ นอกจากนี้ยังใช้ในผลิตภัณฑ์เสริมอาหารเพื่อช่วยในการลดน้ำหนักและควบคุมระดับคอเลสเตอรอล ในด้านการแพทย์และเวชสำอาง ไคโตซานถูกนำมาใช้ในการผลิตแผลผ้าพันแผลที่ช่วยในการสมานแผล รวมถึงเป็นส่วนผสมในครีมบำรุงผิวเพื่อเพิ่มความชุ่มชื้นและลดการระคายเคือง นอกจากนี้ยังมีการใช้ในกระบวนการบำบัดน้ำเสียเพื่อช่วยในการกำจัดสารพิษและโลหะหนัก ไคโตซานยังมีบทบาทสำคัญในเกษตรกรรม โดยใช้เป็นสารเคลือบเมล็ดพันธุ์และสารกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืช ทำให้พืชมีความต้านทานต่อโรคและแมลงมากขึ้น