เอริทโธไมซินแลคโตไบโอเนตใช้กันอย่างแพร่หลายในสถานพยาบาลเป็นยาปฏิชีวนะทางหลอดเลือดดำสำหรับรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียรุนแรง มีประสิทธิภาพสูงต่อการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ การติดเชื้อที่ผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อน และโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์บางชนิด ยานี้มักให้กับผู้ป่วยที่ไม่สามารถรับประทานยาได้หรือต้องการผลทางรักษาที่รวดเร็ว นอกจากนี้ยังใช้ในกรณีที่ยาปฏิชีวนะกลุ่มเพนิซิลลินไม่เหมาะสมเนื่องจากแพ้หรือดื้อยา กิจกรรมสเปกตรัมกว้างทำให้เป็นตัวเลือกที่มีค่าในการต่อสู้กับแบคทีเรียแกรมบวกและบางแกรมลบ รวมถึงพยาธิเชื้อแปลกประหลาดเช่นไมโคพลาสมาและเลกิโอเนลลา เอริทโธไมซินแลคโตไบโอเนตยังใช้ในการป้องกันก่อนผ่าตัดเพื่อป้องกันการติดเชื้อบริเวณแผลผ่าตัด