คลอร์ซูลอนใช้หลักในยาสัตว์เป็นยาถ่ายพยาธิ โดยเฉพาะสำหรับการรักษาการติดเชื้อปรสิต มีประสิทธิภาพสูงต่อพยาธิใบ้ โดยเฉพาะ Fasciola hepatica ซึ่งมักติดเชื้อในปศุสัตว์ เช่น โค กระบือ และแกะ โดยยับยั้งระบบเอนไซม์ของปรสิต ทำให้รบกวนการเผาผลาญพลังงานของพวกมัน นำไปสู่การตาย ช่วยปรับปรุงสุขภาพและผลผลิตของสัตว์ที่ติดเชื้อ มักให้ทางปากหรือฉีด เพื่อการดูดซึมและออกฤทธิ์ที่มีประสิทธิภาพ คลอร์ซูลอนยังใช้ร่วมกับยาต้านปรสิตอื่นๆ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและขยายขอบเขตการออกฤทธิ์ การใช้ยานี้สำคัญในการควบคุมการติดเชื้อปรสิต ซึ่งอาจก่อให้เกิดความสูญเสียทางเศรษฐกิจอย่างมีนัยสำคัญในภาคเกษตร