อะโมรอลฟีน ไฮโดรคลอไรด์ใช้เป็นสารรักษาโรคติดเชื้อราที่ผิวหนังและเล็บ โดยเฉพาะการติดเชื้อราที่เล็บเท้า (onychomycosis) และโรคเชื้อราที่ผิวหนัง เช่น เกลื้อน (tinea versicolor) และเชื้อราที่เท้า (athlete's foot) ตัวยานี้ทำงานโดยการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อรา ทำให้เชื้อราไม่สามารถแพร่พันธุ์และเจริญเติบโตได้ นอกจากนี้ยังมีคุณสมบัติในการฆ่าเชื้อราอีกด้วย ยาชนิดนี้มักใช้ในรูปแบบของครีมหรือสารละลายสำหรับทาบริเวณที่ติดเชื้อ และยังมีรูปแบบของยาทาเล็บที่ใช้ในการรักษาโรคเชื้อราที่เล็บได้อย่างมีประสิทธิภาพ