ไธมอลไฮโดรคลอไรด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อและยาฆ่าเซ็ปติกในแอปพลิเคชันทางการแพทย์และทันตกรรมต่างๆ มีประสิทธิภาพในการควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในน้ำยาบ้วนปาก สเปรย์คอ และผลิตภัณฑ์ดูแลช่องปาก นอกจากนี้ ยังใช้ในยาสัตว์เพื่อรักษาการติดเชื้อและบาดแผลในสัตว์ คุณสมบัติต้านจุลชีพยังขยายไปถึงการถนอมยาและเครื่องสำอาง เพื่อให้มั่นใจในความปลอดภัยและอายุการเก็บรักษาของผลิตภัณฑ์ ในภาคเกษตร ไธมอลไฮโดรคลอไรด์ทำหน้าที่เป็นยาฆ่าเชื้อราและยาฆ่าแบคทีเรีย ปกป้องพืชผลจากพาธาเจนที่เป็นอันตราย ความหลากหลายและประสิทธิภาพทำให้เป็นสารประกอบที่สำคัญในภาคสุขภาพและอุตสาหกรรม