ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากผิวของซิลิกาสามารถทำปฏิกิริยากับกรดไนตริกหรือสารเคมีอื่น ๆ เพื่อจับกับโมเลกุลเป้าหมายได้ อนุภาคแม่เหล็กที่หุ้มด้วย SiO2 ช่วยให้สามารถดึงสารที่ต้องการออกมาได้ง่ายโดยใช้สนามแม่เหล็ก ทำให้กระบวนการแยกสารรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ นิยมใช้ในระบบตรวจวินิจฉัยทางชีวภาพ เช่น การตรวจหาเชื้อไวรัสหรือแบคทีเรีย โดยผ่านการจับกับแอนติบอดีหรือโพรบเฉพาะเจาะจงที่ผูกกับผิวของอนุภาค นอกจากนี้ยังใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย โดยการดัดแปลงผิวให้จับกับโลหะหนักหรือสารพิษ แล้วใช้แม่เหล็กดึงอนุภาคออกจากระบบได้อย่างง่ายดาย ยังสามารถนำไปใช้ในระบบส่งยาเฉพาะจุด โดยอาศัยสนามแม่เหล็กในการควบคุมการเคลื่อนที่ของอนุภาคไปยังตำแหน่งที่ต้องการในร่างกาย