ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากพื้นผิวซิลิกาที่มีกลุ่มอีพ็อกซี่ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพื่อจับกับโมเลกุลเป้าหมายได้ อนุภาคแม่เหล็กเหล่านี้ช่วยให้การแยกสารทำได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ โดยใช้สนามแม่เหล็กดึงอนุภาคออกจากระบบ ทำให้ลดขั้นตอนการกรองหรือปั่นเหวี่ยง

นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ทางชีวภาพ ระบบตรวจสอบเชื้อโรค หรือการเตรียมตัวอย่างสำหรับการตรวจสอบพันธุกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในระบบส่งยาเฉพาะจุด โดยอนุภาคสามารถพาตัวยาเข้าสู่ตำแหน่งเป้าหมายในร่างกายได้เมื่อควบคุมด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก และในงานเสริมความคมชัดสำหรับ MRI

ยังนำไปใช้ในงานด้านสิ่งแวดล้อม เช่น การกำจัดโลหะหนักหรือสารพิษในน้ำ เพราะพื้นผิวของ SiO2 สามารถดูดซับไอออนโลหะได้ดี และสามารถแยกอนุภาคออกจากน้ำได้ง่ายด้วยแม่เหล็ก ช่วยให้กระบวนการบำบัดน้ำมีประสิทธิภาพและต้นทุนต่ำลง