ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ อาร์เอ็นเอ หรือโปรตีนเฉพาะ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากผิวของซิลิกาสามารถดัดแปลงให้จับกับโมเลกุลเฉพาะได้ ช่วยให้แยกสารได้อย่างมีประสิทธิภาพและรวดเร็ว

นิยมใช้ในระบบตรวจวินิจฉัยทางชีวภาพ เช่น ชุดตรวจภูมิคุ้มกัน (immunoassays) และเซ็นเซอร์ชีวภาพ (biosensors) โดยทำให้อนุภาคนี้จับกับแอนติบอดี เพื่อตรวจหาแอนติเจนเป้าหมาย พยาธิ หรือตัวบ่งชี้ชีวภาพ ในตัวอย่างเลือดหรือของเหลวในร่างกาย

เหมาะสำหรับการใช้งานในระบบส่งยาเฉพาะจุด โดยสามารถควบคุมการปลดปล่อยยาได้ด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการรักษาและลดผลข้างเคียง

ใช้ในงานเร่งปฏิกิริยา (catalysis) โดยเปลือก SiO2 ช่วยรักษาความเสถียรของแกนแม่เหล็กและเป็นฐานสำหรับยึดตัวเร่งปฏิกิริยา ทำให้กู้คืนและนำตัวเร่งกลับมาใช้ใหม่ได้ง่าย

ใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย โดยดูดซับโลหะหนักหรือสารอินทรีย์พิษ และสามารถแยกอนุภาคออกจากน้ำได้ง่ายด้วยแม่เหล็ก

มีการนำไปใช้ในห้องปฏิบัติการอัตโนมัติ เพราะสามารถควบคุมการเคลื่อนที่และการแยกอนุภาคได้โดยไม่ต้องปั่นเหวี่ยงหรือกรอง ทำให้กระบวนการทำงานเร็วขึ้นและลดการปนเปื้อน