ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากพื้นผิวของซิลิกาสามารถดัดแปลงให้จับกับโมเลกุลเฉพาะได้ ทำให้แยกและทำให้สารบริสุทธิ์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ นิยมใช้ในระบบตรวจวินิจฉัยทางชีวภาพ เช่น การตรวจหาเชื้อโรคหรือไวรัส โดยผ่านกระบวนการ ELISA หรือการตรวจแบบอิมมูโนอะเซย์ที่ใช้แม่เหล็กช่วยแยกสาร นำไปใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย โดยการดูดซับโลหะหนักหรือสารพิษแล้วใช้สนามแม่เหล็กดึงอนุภาคออกจากระบบได้ง่าย ใช้เป็นตัวพาในระบบส่งยาเฉพาะจุด โดยควบคุมการเคลื่อนที่ด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก ช่วยให้ยาไปยังตำแหน่งเป้าหมายได้อย่างแม่นยำ เหมาะสำหรับใช้ในห้องปฏิบัติการอัตโนมัติ เพราะสามารถควบคุมการเคลื่อนไหวของอนุภาคด้วยแม่เหล็กได้โดยไม่ต้องใช้การปั่นเหวี่ยงหรือกรองด้วยมือ