ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากผิวของซิลิกาสามารถทำปฏิกิริยากับกรดไนตริกหรือสารเคมีอื่นๆ เพื่อจับกับโมเลกุลชีวภาพได้อย่างมีประสิทธิภาพ อนุภาคแม่เหล็กที่ถูกหุ้มด้วย SiO2 ช่วยให้สามารถแยกอนุภาคออกจากสารละลายได้ง่ายโดยใช้สนามแม่เหล็ก ทำให้กระบวนการสกัดและทำให้บริสุทธิ์รวดเร็วและสะดวก นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ทางชีวภาพ เช่น การตรวจหาเชื้อโรคหรือการวินิจฉัยโรคจากตัวอย่างเลือดหรือปัสสาวะ นอกจากนี้ยังใช้ในระบบส่งยาเฉพาะจุด โดยอนุภาคสามารถพาตัวยาไปยังตำแหน่งเป้าหมายในร่างกายได้เมื่อควบคุมด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก ยังนำไปใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย เช่น การดักจับและกำจัดโลหะหนักหรือสารอินทรีย์พิษ โดยการดัดแปลงผิวของ SiO2 ให้จับกับสารปนเปื้อนเฉพาะ แล้วใช้แม่เหล็กดึงอนุภาคออกจากระบบได้อย่างง่ายดาย