ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ โปรตีน หรือเซลล์ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากพื้นผิวของซิลิก้าสามารถดัดแปลงให้จับกับโมเลกุลเฉพาะได้ ช่วยให้แยกและทำให้บริสุทธิ์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยสามารถควบคุมการเคลื่อนที่ด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก

นิยมใช้ในระบบตรวจวินิจฉัยทางชีวภาพ เช่น การตรวจหาเชื้อโรคหรือโปรตีนเฉพาะในเลือด โดยอนุภาคแม่เหล็กทำหน้าที่เป็นตัวพา ช่วยดึงสารเป้าหมายออกจากตัวอย่าง เพื่อเพิ่มความไวและความแม่นยำในการตรวจ

นำไปใช้ในระบบส่งยาเฉพาะจุด โดยควบคุมการเคลื่อนที่ของอนุภาคด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก ทำให้สามารถปล่อยยาไปยังตำแหน่งที่ต้องการในร่างกายได้อย่างแม่นยำ ลดผลข้างเคียงต่อเนื้อเยื่อปกติ

เหมาะสำหรับการใช้ในห้องปฏิบัติการอัตโนมัติ เพราะสามารถแยกอนุภาคออกจากสารละลายได้อย่างรวดเร็วด้วยแม่เหล็ก ทำให้กระบวนการทำงานเร็วขึ้นและลดขั้นตอนการปั่นเหวี่ยง

ใช้ในเทคนิคการถ่ายภาพทางการแพทย์ เช่น MRI ในฐานะสารคอนทราสต์ โดยชั้น SiO2 ที่เข้ากันได้ทางชีวภาพช่วยลดความเป็นพิษและป้องกันการรวมตัวของอนุภาค

นอกจากนี้ยังใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย เช่น การดักจับโลหะหนักหรือสารพิษ โดยปรับพื้นผิวของ SiO2 ให้มีหมู่ที่จับกับสารปนเปื้อนได้ แล้วใช้แม่เหล็กดึงอนุภาคพร้อมสารปนเปื้อนออกจากน้ำ

พบการใช้งานทั่วไปในเซ็นเซอร์ชีวภาพและอุปกรณ์แล็บออนชิป ซึ่งการเคลื่อนที่ที่ควบคุมได้และพื้นที่ผิวสูงช่วยเพิ่มความไวในการตรวจจับ