ใช้ในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากผิวของซิลิกาสามารถดัดแปลงให้จับกับโมเลกุลเฉพาะได้ ช่วยให้แยกสารได้อย่างมีประสิทธิภาพและรวดเร็ว นิยมใช้ในระบบตรวจวินิจฉัยทางชีวภาพ เช่น การตรวจหาเชื้อโรคหรือไวรัส โดยทำให้อนุภาคมีการจับกับแอนติบอดีหรือสารจับเฉพาะเป้าหมาย แล้วใช้สนามแม่เหล็กดึงแยกออกมา ใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย โดยอนุภาคสามารถดูดซับโลหะหนักหรือสารพิษ และนำออกจากระบบได้ง่ายด้วยแม่เหล็ก เหมาะสำหรับการส่งยาเฉพาะจุดในร่างกาย เพราะสามารถควบคุมการเคลื่อนที่ด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก และปล่อยยาที่ตำแหน่งเป้าหมายได้ ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยา (catalyst support) ในปฏิกิริยาเคมีต่าง ๆ เนื่องจากมีพื้นที่ผิวมาก และสามารถนำกลับมาใช้ใหม่ได้โดยการดึงด้วยแม่เหล็ก