ใช้ไคโตซานในหลากหลายอุตสาหกรรมเนื่องจากมีคุณสมบัติย่อยสลายได้ ไม่เป็นพิษ และสามารถดูดซับสารต่างๆ ได้ดี ในการแพทย์ ใช้ทำวัสดุปิดแผลเพราะช่วยยับยั้งการติดเชื้อและส่งเสริมการหายของแผล รวมถึงใช้ในระบบส่งยาให้ค่อยๆ ปลดปล่อยยาอย่างมีประสิทธิภาพ ในอุตสาหกรรมอาหาร ใช้เป็นสารกันเสียตามธรรมชาติเพื่อยืดอายุการเก็บรักษาอาหาร โดยเฉพาะผลไม้สดและอาหารทะเล นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตกตะกอนในกระบวนการบำบัดน้ำ เพราะสามารถจับกับอนุภาคสิ่งสกปรกและโลหะหนักได้ดี ในด้านเกษตรกรรม ไคโตซานใช้เป็นสารกระตุ้นภูมิคุ้มกันของพืช ช่วยป้องกันโรคจากเชื้อราและแมลงศัตรูพืช รวมถึงใช้ในผลิตภัณฑ์เคลือบเมล็ดพันธุ์เพื่อเพิ่มอัตราการงอก นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในเครื่องสำอาง เช่น ครีมบำรุงผิวและแชมพู เนื่องจากช่วยรักษาความชุ่มชื้นและมีคุณสมบัติต้านการอักเสบ