ไพเพอราซีน เฮกซะไฮเดรตถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นยาระบายพยาธิที่มีประสิทธิภาพในการรักษาการติดเชื้อพยาธิในมนุษย์และสัตว์ เช่น พยาธิเส้นด้ายและพยาธิปากขอ โดยทำงานผ่านการทำให้พยาธิเป็นอัมพาตเพื่อให้สามารถขับออกจากร่างกายได้ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่างๆ รวมถึงยาต้านฮิสตามีนและยารักษาโรคจิตเภทต่างๆ ในด้านการใช้งานอุตสาหกรรม ใช้เป็นสารยับยั้งการกัดกร่อนในระบบหล่อเย็นและเป็นสารเร่งการแข็งตัวในการผลิตเรซินอีพ็อกซี่ ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงภาคเกษตรกรรม ซึ่งใช้ในการปรุงสูตรสารกำจัดศัตรูพืชบางชนิด