Hexetidine ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อและต้านเชื้อราในผลิตภัณฑ์ดูแลช่องปาก เช่น น้ำยาบ้วนปากและสเปรย์สำหรับลำคอ ช่วยลดแบคทีเรียในช่องปาก ป้องกันการติดเชื้อ และรักษาโรคเช่นโรคเหงือกอักเสบและเชื้อราในช่องปาก (oral thrush) นอกจากนี้ ยังช่วยควบคุมกลิ่นปากโดยยับยั้งการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดกลิ่น ในด้านผิวหนัง Hexetidine ใช้ทาเพื่อรักษาการติดเชื้อผิวหนังเล็กน้อยและแผลเนื่องจากคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ยังใช้ในยาสัตว์เพื่อวัตถุประสงค์ฆ่าเชื้อที่คล้ายกันในสัตว์