เกลือโซเดียมคลอโพรสเตนอลถูกใช้อย่างแพร่หลายในยาสัตว์ โดยเฉพาะในการจัดการหน้าที่การสืบพันธุ์ในปศุสัตว์ โดยหลักแล้วใช้ในการทำให้การเป็นสัดซิงโครนัสในวัว เพื่อให้โปรแกรมการเพาะพันธุ์มีประสิทธิภาพมากขึ้น โดยการเหนี่ยวนำการสลายอัลลูเทียม (luteolysis) ช่วยในการควบคุมเวลาการตกไข่ ซึ่งสำคัญสำหรับการผสมเทียม นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาโรคเช่น หนองในมดลูก (pyometra) และเยื่อบุโพรงมดลูกอักเสบเรื้อรัง (chronic endometritis) ในวัว ช่วยในการขับถ่ายเนื้อหาในมดลูกและปรับปรุงสุขภาพการสืบพันธุ์ ในหมู ใช้ในการเหนี่ยวนำการคลอด (farrow induction) เพื่อให้หมูแม่คลอดภายในกรอบเวลาที่ต้องการ ซึ่งช่วยเสริมการจัดการการดำเนินงานการคลอด ประสิทธิภาพในการควบคุมวงจรการสืบพันธุ์ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในปศุสัตว์สมัยใหม่ สนับสนุนการเพิ่มผลผลิตและการจัดการฝูงที่ดีขึ้น