ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นสารตั้งต้นในการผลิตยาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ หมู่ไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับปรับปรุงการดูดซึมยาและความต้านทานต่อการย่อยสลาย นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลงบางชนิด โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันได้ง่าย สนับสนุนการใช้ในปฏิกิริยาคัปปลิ้งต่างๆ ระหว่างการสังเคราะห์อินทรีย์