ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาต้านไวรัส โครงสร้าง pyrimidine ที่มีกลุ่ม trifluoromethyl ช่วยในการออกแบบโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพโดยเพิ่มความเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึม ความสามารถในการจับมัด และการซึมผ่านเซลล์ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการสร้างยาที่มีฐาน pyrimidine เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง หรือยารักษาโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากคุณสมบัติดึงอิเล็กตรอนและความสามารถในการเพิ่มความคงตัวของสารประกอบในสภาพแวดล้อม รวมถึงใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารไลบรารีสำหรับการคัดกรองทางชีวภาพในห้องปฏิบัติการ