ไนทาโซซาไนด์ใช้ในการรักษาการติดเชื้อที่เกิดจากปรสิตและโปรโตซัวในระบบทางเดินอาหาร เช่น โรคท้องร่วงที่เกิดจากเชื้อไจอาร์เดีย (Giardia lamblia) และคริปโตสปอริเดียม (Cryptosporidium parvum) โดยยาชนิดนี้ช่วยยับยั้งการเจริญเติบโตและทำลายเชื้อก่อโรค นอกจากนี้ยังมีการศึกษาว่าอาจมีประสิทธิภาพในการรักษาการติดเชื้อไวรัสบางชนิด เช่น ไข้หวัดใหญ่ เนื่องจากมีคุณสมบัติต้านไวรัส ไนทาโซซาไนด์มักใช้ในรูปแบบยารับประทานและมีประสิทธิภาพสูงในการลดอาการและระยะเวลาของการติดเชื้อ