ใช้ในทางการแพทย์เพื่อป้องกันและรักษาลิ่มเลือดอุดตัน โดยเฉพาะในผู้ป่วยที่มีภาวะเกล็ดเลือดต่ำจากการใช้เฮพาริน (HIT) ซึ่งไม่สามารถใช้เฮพารินได้ จึงใช้อาร์การ์โทร์แบนเป็นทางเลือกแทน มีผลยับยั้งการแข็งตัวของเลือดโดยไปยับยั้งเอนไซม์ thrombin โดยตรง ทำให้ลดการสร้างลิ่มเลือด ใช้ผ่านการให้ทางหลอดเลือดดำอย่างต่อเนื่อง โดยเฉพาะในช่วงก่อนหรือระหว่างทำหัตถการ เช่น การฟอกเลือด หรือการผ่าตัดหัวใจ ต้องควบคุมอัตราการให้ยาอย่างใกล้ชิดเพื่อป้องกันภาวะเลือดออกผิดปกติ